Gen MC4R dikenal sebagai kandidat gen untuk sifat pertumbuhan. Penelitian ini bertujuan untuk
mengidentifikasi gen MC4R pada sapi Peranakan Ongole (PO) Kebumen dan hubungannya terhadap
sifat pertumbuhan ternak tersebut. Data bobot lahir (BL), bobot sapih (BS), panjang badan lahir (PBL),
lingkar dada lahir (LDL), tinggi gumba (TG), panjang badan sapih (PBS), lingkar dada sapih (LDS),
tinggi gumba sapih (TGS) dan rata-rata pertumbuhan bobot badan harian (ADG) digunakan untuk
analisis asosiasi berdasarkan gen MC4R. Total 60 sampel darah diambil dan digunakan untuk isolasi
DNA. Produk PCR diamplifikasi dengan menggunakan primer forward 5’-
GTCGGGCGTCTTGTTCATC-3’ dan reverse 5’ GCTTGTGTTTAGCATCGCGT-3’. Single Nucleotide
Polymorphisms (SNP) g.1133 C>G digunakan untuk proses genotyping menggunakan metode PCRRFLP dengan enzim restriksi HpyCH4IV. Frekuensi alel G (0,59) lebih besar dibandingkan dengan alel
C (0.41). Frekuensi genotip tertinggi dimiliki oleh ternak bergenotip heterozigot CG, diikuti dengan
ternak bergenotipe homozigot GG (0,33) dan CC (0,15). Hasil uji Chi-square menunjukkan populasi
tidak menyimpang (P>0,05) dari Hardy-Weinberg Equilibrium (HWE). Hasil analisis asosiasi
menunjukkan bahwa SNP g. 1133 C>G pada gen MC4R berpengaruh nyata terhadap panjang badan
lahir ternak dengan genotip GG (PG dapat digunakan sebagai
marker untuk seleksi sapi PO Kebumen berdasarkan sifat panjang badan saat lahir