Gene melanocortin 4 receptor (MC4R) memainkan peran penting pada aktivitas syaraf, adrenal,
fungsi tiroid dan mediasi efek leptin dalam keseimbangan energi. Penelitian ini bertujuan untuk
mengetahui efek 642 bp gen MC4R pada feed intake, kecernaan nutrien, pertambahan bobot badan
harian (PBBH) dan feed conversion rate (FCR) pada kambing Bligon pasca sapih. Sebanyak 46 ekor
kambing Bligon yang memiliki data diambil sampel darahnya kemudian diisolasi deoxyribo nucleic acid
(DNA) menggunakan Geneaid isolation kit. Data feed intake dikoleksi pada 2 tempat yang berbeda yaitu
di Laboratorium Fakultas Peternakan (LFP) UGM (n=23) dan Banyusoco (n=23). Variabel yang diamati
yaitu feed intake, kecernaan nutrien, PBBH dan FCR. Penentuan genotip menggunakan metode PCRRFLP dengan enzim Kpn1 pada semua sampel kambing Bligon. Hasil penelitian menunjukkan terdapat
satu polimorfisme di ekson (g.1079C/T). Analisis T-tes menunjukkan adanya asosiasi yang signifikan
antara single nucleotide polymorphism (SNP) g.1079C/T dan kecernaan BK, bahan organik (BO) dan
TDN pada kambing Bligon umur 7 bulan yang dipelihara di LFP UGM, sementara pada kambing Bligon
yang dipelihara di Banyusoco terdapat perbedaan pada kecernaan bahan kering (BK), PK, ETN dan
total digestible nutrient (TDN). Hasil penelitian dapat disimpulkan bahwa SNP g.1079C/T dapat
digunakan untuk penentuan genotip kambing Bligon dan MAS untuk kecernaan nutrien